L'église orthodoxe de Saint-Nicolas a été fondée à Lyon les représentants de la communauté russe qui a émigré en France après la révolution de 1917.

Le premier temple, fondé en 1928, logés dans un bâtiment sur la rue de Tambour. Il a été nommé en l'honneur du célèbre saint, ainsi que comme un souvenir d'расстрелянном avec la famille de l'empereur Nicolas Deuxième. Le premier recteur de l'église est devenu le père de Victor (Pouchkine), ancien prêtre de régiment.

En 1937, un lieu de culte, probablement à cause d'un incendie a brûlé entièrement. Sa restauration a commencé en seulement deux ans plus tard – pour la construction d'un bâtiment en pierre ont choisi un nouvel emplacement sur la rue Sainte-Geneviève. Le temple a été créé sur le projet d'expatriés Sergei Баздерева. La construction du temple était conduite par les forces de l'abbé et des paroissiens à des dons recueillis, le travail a été effectué le soir et le week-end, donc la construction d'un bien avancé très lentement. Même pendant la Seconde guerre mondiale, malgré les bombardements et le manque de fonds, les travaux se sont poursuivis. Et la finition intérieure du temple s'est poursuivie et encore dans la période d'après-guerre. La consécration du temple a eu lieu en mai 1946.

Dans les années 1970 dans le temple, après l'effondrement d'un plafond a été rénové. Vers la fin du siècle dernier autour de l'église ont augmenté les quartiers résidentiels, et quand à côté de lui a ouvert la station de métro, le nombre de membres a augmenté. L'une des icônes du temple, est dédiée à saint Irénée Лионскому – l'évêque de Lyon, qui a accepté le martyre pour la foi en 202 av.

Le temple de Saint-Nicolas à Lyon n'est riche décoration et l'architecture d'origine, mais il est appelé le monument de la première vague de l'émigration et le symbole de l'amour à la foi orthodoxe.

À Lyon il y a d'autres églises orthodoxes russes, par exemple, l'église de Saint Jean le Russe.