La première université de Pécs est apparu en 1367, comme l'une des plus anciennes en Europe Centrale, le roi Louis-le-Grand, elle est allée sous les dans le temps de l'occupation turque. En 1921, l'ex-Hongrois de l'université de Bratislava. Bratislava, hongrois : Пожонь ) a déménagé à Pécs, c'est результатом1982 Janus Паннониус de l'université ( Janus Паннониус Tudományegyetem, JPTE ).

La première université de Pécs a été créé par Louis I de la Hongrie en 1367. À l'affiche comme un centre éducatif de plusieurs décennies, au milieu du 15ème siècle, il a été divisé en deux écoles de la jurisprudence et de la théologie. Pendant l'occupation turque de l'université a été fermée, et a ouvert ses portes qu'en 1785, lorsque Joseph II a voyagé à l'Académie Royale de Györ à Pécs. En 1802, Académie Royale est revenue à Győr, sur ordre de François ier, et des institutions d'enseignement supérieur dans le Peche n'était pas jusqu'en 1833, quand l'évêque de Pécs, sous les auspices de l'urbain, du sénat a été fondé dans l'Académie de Peche avec les facultés de droit et de la philosophie.

Moderne, université de Pécs a été fondé en 1912 et se trouvait à l'origine dans Пожонь (aujourd'hui Bratislava). Après la Première guerre mondiale Пожонь a été анексирован de la Hongrie, et, en 1921, l'université a déménagé à Pécs, où il reste jusqu'à ce jour. En 1951, à la faculté de médecine de l'université a été séparé, et jusqu'en 2000, a été séparée de l'institution. En 1982, l'université a reçu le nom de Janus Паннониуса. Le présent de l'université de Pécs a été créé le 1er janvier 2000, par la fusion de l'université de Janus Паннониуса, l'université Médicale de ville et le collège pédagogique.