Selon la légende, le nom de "Мишарина montagne" provient d'un дьяка Мунехина Мисюри, qui vivait dans la première moitié du 16ème siècle et qui était connu pour sa charité envers Dieu, les eglises. Autorité ethnographe Окулич-Казарин N.Sh. préfère le plus vraisemblable version de l'origine du nom de temple de petits marais, portant le nom de мшары, en effet, c'est le genre de marais autrefois dans l'antiquité et a été entouré par la montagne.
L'érection d'une église en pierre est arrivé en 1547. A l'origine le temple a été pour le monastère. Dans les enregistrements Писцовой livre 1623 mentionné sur le masculin Котельниковом du Мишариной de la montagne. C'est sur ce monastère, il est écrit dans Четьях минеях de la Russie, le métropolite Macaire. Il ya de spéculation que l'abbé Котельникова monastère pendant des années 60 du 16ème siècle a été Basile-Barlaam, qui est l'auteur de la vie d'Alexandre Nevski, Евфросина de Pskov.
En 1808, le temple était destiné à la démolition comme très ancien, mais tout de même le Saint-Synode n'est pas donné leur consentement à cette action. En 1882, un marchand de Pskov Стехновским Pierre Mikhaïlovitch avant de la porte d'entrée a été construite en pierre de la charpente. Tout au long de 1892-1896, a effectué les travaux de restauration sur la trésorerie d'un marguillier – Kafelnikov Ivan Mikhaïlovitch de russie – citoyen d'honneur de la ville de Pskov. L'église a deux trône, dont le principal est le trône de l'Évangéliste et Apôtre Jean le Théologien, et le second nommé au nom du Saint Martyr Jean Guerrier. Tout au long de 1786-1808 années à l'église, a été attribué à un lieu de culte Georges avec Взвоза, et, en 1934 ont attribué l'église de saint-Saints, le Roi Constantin et de sa mère, la Reine Hélène.
Le clocher de l'église a été construite en même temps que la construction du temple de Jean le Baptiste. Sur le clocher suspendu six cloches. Dans la paroisse était trois chapelles, construites à partir de bois: de saint-nicolas et de Saint-Nicolas, à proximité du village de Хрястолово, Saint Martyr Anastasia et Vénérable martyre d'Anastasia.
L'église saint Jean-Baptiste il y avait hospice, église paroissiale tutelle, à l'hôpital, mais l'église paroissiale de l'école n'a été construite. À la fin du 19ème siècle, dans un village appelé Chèvre Gué a été construite l'église, l'école paroissiale, mais bientôt, en 1895, en raison de la proximité à d'autres écoles urbaines, elle a été fermée.
Sur le périmètre de l'ensemble de l'église se trouve le cimetière où sont enterrés historien et ethnographe Цвылев C. A., le restaurateur de Smirnov S. P., ainsi que les soldats tués au cours de l'exécution de son combat de la dette.
Depuis 1913, dans le temple a servi de prêtre Колобов Fiodor Vassilievitch. En 1927, après avoir, à plusieurs reprises arrêté, Fiodor Vassilievitch est banni de l'Oural. Femme Колобова le suivit, après quoi sur eux aucune information n'a été reçue. Псаломщиком-diacre a été Mikhaïl Lebedev, mais sa vie plus tard inconnu.
Le 23 décembre 1936, il a été décidé de la fermeture de l'église, mais selon d'autres sources, le culte s'est poursuivie jusqu'à la Grande guerre Patriotique. En temps de guerre, le temple a reçu des dommages des murs, des toitures, la finition intérieure et extérieure. Tout au long de 1970-1989, sous la supervision de l'architecte Lebedev S. A. a été la tenue d'une restauration complète de l'église. 3 mars 1965, le cimetière de l'église a été fermée pour la sépulture.
Les premiers services ont commencé à être menées en 1992, à l'entrée du temple. La renaissance de l'église Saint Jean-Baptiste est étroitement liée avec le nom de la célèbre abbé Jonas. A contribué à la restauration de l'église et le directeur de câble de pskov usine Kukushkin Viktor Petrovitch.
En 2001, l'archevêque de Pskov Eusèbe a accompli le rite de la consécration de huit cloches, qui ont été coulées dans la ville de Voronej, selon l'ancienne méthode. Aujourd'hui, dans l'église, toute l'école de dimanche et est de pèlerinage de service qui a obtenu le statut de diocésaine.