Le musée juif se trouve dans la maison de Wertheimer, historique, nommé en l'honneur de hongrois, le rabbin Samson Вертгеймера (1658-1724). La décision au sujet de la fondation du musée juif à Eisenstadt a été adoptée en 1969, sur le forum de l'Institut des études juives lors de l'université de Vienne. Le musée a été ouvert trois ans plus tard, en 1972.

Le musée juif occupe une surface de près de 1000 mètres carrés et est divisé en plusieurs salles d'exposition.

Lors d'une visite du musée, vous pouvez voir privée de la synagogue, située au premier étage de l'immeuble. Cette petite synagogue est l'un des rares qui n'a pas souffert pendant la «nuit de Cristal» (ou «la Nuit des vitrines cassées») en novembre 1938. Il a été le premier à une aussi grande échelle de l'attaque des nazis sur les juifs. Cette nuit-là a une vague de pogromes juifs sur le territoire du Troisième Reich, a été détruit 267 synagogues, assassiné 91 juif, des centaines de blessés et d'être mutilées, des milliers ont subi les humiliations et les insultes, plus de 30 millions ont été envoyés dans des camps de concentration.

Aussi, le musée propose de se familiariser avec sa une exposition permanente, qui donne un tableau complet de la vie juive et de l'histoire des juifs dans le Burgenland. À la fin de l'exposition se trouve l'impressionnant mémorial de réunions, créé à la mémoire des sept célèbres communautés juives du Burgenland.

Aussi, le musée possède une bibliothèque qui contient plus de 10.000 volumes. La partie des livres se trouvent dans l'exposition permanente du musée, il s'agit surtout d'un livre du 18ème siècle. En outre, la bibliothèque possède une grande collection de fac-éditions de livres connus. Une attention particulière mérite une précieuse collection de livres en yiddish.

Le musée est situé dans le quartier de Унтерштадт (basse-Ville), où, depuis 1670, se sont installés près de 3000 juifs, chassés de Vienne. À proximité de musée sont deux anciens cimetières juifs.